Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBL1

Tigd2, Tigger transposable element-derived protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tigd2Q0VBL1 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tigd2Q0VBL1 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tigd2Q0VBL1 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tigd2Q0VBL1 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Tigd2Q0VBL1 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tigd2Q0VBL1 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tigd2Q0VBL1 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tigd2Q0VBL1 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Tigd2Q0VBL1 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tigd2Q0VBL1 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tigd2Q0VBL1 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tigd2Q0VBL1 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tigd2Q0VBL1 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tigd2Q0VBL1 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tigd2Q0VBL1 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tigd2Q0VBL1 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tigd2Q0VBL1 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tigd2Q0VBL1 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tigd2Q0VBL1 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tigd2Q0VBL1 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tigd2Q0VBL1 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tigd2Q0VBL1 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tigd2Q0VBL1 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tigd2Q0VBL1 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tigd2Q0VBL1 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tigd2Q0VBL1 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tigd2Q0VBL1 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tigd2Q0VBL1 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tigd2Q0VBL1 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tigd2Q0VBL1 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tigd2Q0VBL1 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tigd2Q0VBL1 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tigd2Q0VBL1 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tigd2Q0VBL1 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tigd2Q0VBL1 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tigd2Q0VBL1 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tigd2Q0VBL1 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tigd2Q0VBL1 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tigd2Q0VBL1 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Tigd2Q0VBL1 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tigd2Q0VBL1 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Tigd2Q0VBL1 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tigd2Q0VBL1 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tigd2Q0VBL1 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tigd2Q0VBL1 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tigd2Q0VBL1 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tigd2Q0VBL1 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tigd2Q0VBL1 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tigd2Q0VBL1 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tigd2Q0VBL1 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Tigd2Q0VBL1 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tigd2Q0VBL1 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tigd2Q0VBL1 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tigd2Q0VBL1 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tigd2Q0VBL1 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tigd2Q0VBL1 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tigd2Q0VBL1 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tigd2Q0VBL1 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tigd2Q0VBL1 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tigd2Q0VBL1 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tigd2Q0VBL1 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tigd2Q0VBL1 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tigd2Q0VBL1 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tigd2Q0VBL1 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tigd2Q0VBL1 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tigd2Q0VBL1 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tigd2Q0VBL1 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tigd2Q0VBL1 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tigd2Q0VBL1 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tigd2Q0VBL1 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tigd2Q0VBL1 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tigd2Q0VBL1 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tigd2Q0VBL1 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tigd2Q0VBL1 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tigd2Q0VBL1 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tigd2Q0VBL1 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tigd2Q0VBL1 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tigd2Q0VBL1 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Tigd2Q0VBL1 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tigd2Q0VBL1 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tigd2Q0VBL1 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Tigd2Q0VBL1 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Tigd2Q0VBL1 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Tigd2Q0VBL1 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tigd2Q0VBL1 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tigd2Q0VBL1 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tigd2Q0VBL1 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tigd2Q0VBL1 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tigd2Q0VBL1 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tigd2Q0VBL1 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tigd2Q0VBL1 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tigd2Q0VBL1 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tigd2Q0VBL1 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tigd2Q0VBL1 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tigd2Q0VBL1 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tigd2Q0VBL1 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tigd2Q0VBL1 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tigd2Q0VBL1 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tigd2Q0VBL1 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tigd2Q0VBL1 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms