Protein–RNA interactions for Protein: Q0P678

Zc3h18, Zinc finger CCCH domain-containing protein 18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h18Q0P678 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zc3h18Q0P678 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms