Protein–RNA interactions for Protein: Q08943

Ssrp1, FACT complex subunit SSRP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssrp1Q08943 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ssrp1Q08943 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms