Protein–RNA interactions for Protein: Q07916

Pou6f1, POU domain, class 6, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou6f1Q07916 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms