Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms