Protein–RNA interactions for Protein: Q05909

Ptprg, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprgQ05909 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PtprgQ05909 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PtprgQ05909 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PtprgQ05909 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PtprgQ05909 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PtprgQ05909 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PtprgQ05909 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PtprgQ05909 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PtprgQ05909 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PtprgQ05909 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PtprgQ05909 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PtprgQ05909 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PtprgQ05909 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PtprgQ05909 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PtprgQ05909 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PtprgQ05909 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PtprgQ05909 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PtprgQ05909 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PtprgQ05909 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PtprgQ05909 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PtprgQ05909 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PtprgQ05909 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PtprgQ05909 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PtprgQ05909 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PtprgQ05909 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms