Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Mterf1a-201ENSMUST00000044746 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Tceal9-202ENSMUST00000113115 888 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Gm11858-201ENSMUST00000117935 838 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 AC134439.1-201ENSMUST00000220923 600 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Zmym2-202ENSMUST00000223669 1281 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Zfp966-202ENSMUST00000109018 733 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Zfp968-202ENSMUST00000109048 733 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Gm16434-202ENSMUST00000177712 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Gm6676-202ENSMUST00000178376 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Esp18-201ENSMUST00000179848 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Olfr1315-ps1-201ENSMUST00000207542 1230 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Prl7a1-203ENSMUST00000224852 1283 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Prl7a1-201ENSMUST00000006659 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Gm17790-201ENSMUST00000191545 1228 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Gm43550-201ENSMUST00000200597 303 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 4930447F04Rik-201ENSMUST00000033525 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Gm26226-201ENSMUST00000082509 116 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms