Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Gm28925-201ENSMUST00000188586 168 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Gm42565-201ENSMUST00000197839 572 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Gm43066-201ENSMUST00000199589 1260 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 AC102542.1-201ENSMUST00000225204 1138 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Smpd1Q04519 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Smpd1Q04519 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Smpd1Q04519 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Smpd1Q04519 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Smpd1Q04519 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Smpd1Q04519 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smpd1Q04519 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smpd1Q04519 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smpd1Q04519 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smpd1Q04519 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smpd1Q04519 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smpd1Q04519 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Smpd1Q04519 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smpd1Q04519 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smpd1Q04519 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smpd1Q04519 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smpd1Q04519 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Smpd1Q04519 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Smpd1Q04519 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Smpd1Q04519 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smpd1Q04519 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Smpd1Q04519 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Smpd1Q04519 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Smpd1Q04519 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smpd1Q04519 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smpd1Q04519 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.2 ms