Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tff2Q03404 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms