Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Msx2Q03358 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Msx2Q03358 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Msx2Q03358 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Msx2Q03358 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Msx2Q03358 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Msx2Q03358 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Msx2Q03358 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Msx2Q03358 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Msx2Q03358 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Msx2Q03358 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Msx2Q03358 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Msx2Q03358 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Msx2Q03358 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Msx2Q03358 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Msx2Q03358 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Msx2Q03358 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Msx2Q03358 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Msx2Q03358 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Msx2Q03358 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms