Protein–RNA interactions for Protein: Q03347

Runx1, Runt-related transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Runx1Q03347 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms