Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cacna1sQ02789 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cacna1sQ02789 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cacna1sQ02789 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cacna1sQ02789 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cacna1sQ02789 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cacna1sQ02789 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cacna1sQ02789 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cacna1sQ02789 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cacna1sQ02789 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cacna1sQ02789 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cacna1sQ02789 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cacna1sQ02789 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cacna1sQ02789 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cacna1sQ02789 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cacna1sQ02789 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cacna1sQ02789 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cacna1sQ02789 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacna1sQ02789 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacna1sQ02789 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacna1sQ02789 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacna1sQ02789 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacna1sQ02789 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacna1sQ02789 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacna1sQ02789 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacna1sQ02789 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacna1sQ02789 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacna1sQ02789 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacna1sQ02789 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacna1sQ02789 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacna1sQ02789 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacna1sQ02789 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacna1sQ02789 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacna1sQ02789 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacna1sQ02789 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacna1sQ02789 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacna1sQ02789 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacna1sQ02789 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacna1sQ02789 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacna1sQ02789 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacna1sQ02789 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacna1sQ02789 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacna1sQ02789 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacna1sQ02789 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacna1sQ02789 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacna1sQ02789 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacna1sQ02789 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacna1sQ02789 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacna1sQ02789 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacna1sQ02789 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacna1sQ02789 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacna1sQ02789 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacna1sQ02789 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacna1sQ02789 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacna1sQ02789 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacna1sQ02789 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacna1sQ02789 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacna1sQ02789 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacna1sQ02789 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacna1sQ02789 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cacna1sQ02789 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cacna1sQ02789 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cacna1sQ02789 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cacna1sQ02789 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cacna1sQ02789 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cacna1sQ02789 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cacna1sQ02789 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cacna1sQ02789 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cacna1sQ02789 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cacna1sQ02789 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cacna1sQ02789 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cacna1sQ02789 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cacna1sQ02789 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cacna1sQ02789 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cacna1sQ02789 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cacna1sQ02789 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacna1sQ02789 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms