Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gjb4Q02738 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms