Protein–RNA interactions for Protein: Q02248

Ctnnb1, Catenin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnb1Q02248 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctnnb1Q02248 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctnnb1Q02248 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctnnb1Q02248 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctnnb1Q02248 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctnnb1Q02248 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctnnb1Q02248 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctnnb1Q02248 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctnnb1Q02248 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctnnb1Q02248 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctnnb1Q02248 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctnnb1Q02248 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctnnb1Q02248 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctnnb1Q02248 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctnnb1Q02248 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctnnb1Q02248 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctnnb1Q02248 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctnnb1Q02248 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctnnb1Q02248 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctnnb1Q02248 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ctnnb1Q02248 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ctnnb1Q02248 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ctnnb1Q02248 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ctnnb1Q02248 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnnb1Q02248 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnnb1Q02248 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnnb1Q02248 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnnb1Q02248 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnnb1Q02248 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnnb1Q02248 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnnb1Q02248 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnnb1Q02248 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnnb1Q02248 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnnb1Q02248 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnnb1Q02248 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnnb1Q02248 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnnb1Q02248 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnnb1Q02248 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnnb1Q02248 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnnb1Q02248 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnnb1Q02248 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnnb1Q02248 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnnb1Q02248 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnnb1Q02248 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnnb1Q02248 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnnb1Q02248 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnnb1Q02248 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnnb1Q02248 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnnb1Q02248 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnnb1Q02248 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnnb1Q02248 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnnb1Q02248 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnnb1Q02248 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnnb1Q02248 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnnb1Q02248 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnnb1Q02248 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnnb1Q02248 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnnb1Q02248 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnnb1Q02248 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnnb1Q02248 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnnb1Q02248 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnnb1Q02248 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnnb1Q02248 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnnb1Q02248 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnnb1Q02248 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnnb1Q02248 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnnb1Q02248 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnnb1Q02248 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnnb1Q02248 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnnb1Q02248 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnnb1Q02248 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnnb1Q02248 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnnb1Q02248 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnnb1Q02248 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnnb1Q02248 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnnb1Q02248 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnnb1Q02248 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnnb1Q02248 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnnb1Q02248 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnnb1Q02248 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnnb1Q02248 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnnb1Q02248 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnnb1Q02248 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnnb1Q02248 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnnb1Q02248 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnnb1Q02248 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnnb1Q02248 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnnb1Q02248 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnnb1Q02248 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnnb1Q02248 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctnnb1Q02248 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctnnb1Q02248 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctnnb1Q02248 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctnnb1Q02248 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctnnb1Q02248 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctnnb1Q02248 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctnnb1Q02248 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctnnb1Q02248 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctnnb1Q02248 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctnnb1Q02248 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms