Protein–RNA interactions for Protein: Q02242

Pdcd1, Programmed cell death protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd1Q02242 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdcd1Q02242 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms