Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms