Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VcpQ01853 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VcpQ01853 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VcpQ01853 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VcpQ01853 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VcpQ01853 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VcpQ01853 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VcpQ01853 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VcpQ01853 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VcpQ01853 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VcpQ01853 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VcpQ01853 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VcpQ01853 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VcpQ01853 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VcpQ01853 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms