Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cacna1cQ01815 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms