Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms