Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Top2aQ01320 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Top2aQ01320 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Top2aQ01320 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Top2aQ01320 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Top2aQ01320 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Top2aQ01320 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Top2aQ01320 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Top2aQ01320 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Top2aQ01320 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Top2aQ01320 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Top2aQ01320 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Top2aQ01320 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Top2aQ01320 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Top2aQ01320 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Top2aQ01320 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Top2aQ01320 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Top2aQ01320 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Top2aQ01320 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Top2aQ01320 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Top2aQ01320 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Top2aQ01320 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Top2aQ01320 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Top2aQ01320 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Top2aQ01320 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Top2aQ01320 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Top2aQ01320 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Top2aQ01320 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Top2aQ01320 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Top2aQ01320 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Top2aQ01320 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Top2aQ01320 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Top2aQ01320 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Top2aQ01320 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Top2aQ01320 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Top2aQ01320 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Top2aQ01320 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Top2aQ01320 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Top2aQ01320 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Top2aQ01320 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Top2aQ01320 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Top2aQ01320 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Top2aQ01320 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Top2aQ01320 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Top2aQ01320 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Top2aQ01320 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Top2aQ01320 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Top2aQ01320 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Top2aQ01320 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Top2aQ01320 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Top2aQ01320 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Top2aQ01320 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Top2aQ01320 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Top2aQ01320 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Top2aQ01320 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Top2aQ01320 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Top2aQ01320 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Top2aQ01320 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Top2aQ01320 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Top2aQ01320 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Top2aQ01320 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Top2aQ01320 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Top2aQ01320 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Top2aQ01320 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Top2aQ01320 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Top2aQ01320 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Top2aQ01320 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Top2aQ01320 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Top2aQ01320 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Top2aQ01320 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Top2aQ01320 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Top2aQ01320 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Top2aQ01320 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Top2aQ01320 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Top2aQ01320 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Top2aQ01320 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Top2aQ01320 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Top2aQ01320 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Top2aQ01320 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Top2aQ01320 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Top2aQ01320 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Top2aQ01320 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Top2aQ01320 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Top2aQ01320 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Top2aQ01320 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Top2aQ01320 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Top2aQ01320 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Top2aQ01320 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Top2aQ01320 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Top2aQ01320 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Top2aQ01320 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Top2aQ01320 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Top2aQ01320 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Top2aQ01320 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Top2aQ01320 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Top2aQ01320 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Top2aQ01320 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Top2aQ01320 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Top2aQ01320 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Top2aQ01320 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms