Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grin2cQ01098 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grin2cQ01098 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grin2cQ01098 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grin2cQ01098 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grin2cQ01098 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grin2cQ01098 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grin2cQ01098 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grin2cQ01098 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grin2cQ01098 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grin2cQ01098 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grin2cQ01098 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grin2cQ01098 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grin2cQ01098 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grin2cQ01098 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grin2cQ01098 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grin2cQ01098 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grin2cQ01098 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Grin2cQ01098 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grin2cQ01098 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grin2cQ01098 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grin2cQ01098 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grin2cQ01098 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grin2cQ01098 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grin2cQ01098 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grin2cQ01098 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grin2cQ01098 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grin2cQ01098 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grin2cQ01098 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grin2cQ01098 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grin2cQ01098 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grin2cQ01098 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grin2cQ01098 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grin2cQ01098 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grin2cQ01098 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grin2cQ01098 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grin2cQ01098 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grin2cQ01098 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grin2cQ01098 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grin2cQ01098 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grin2cQ01098 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Grin2cQ01098 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grin2cQ01098 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Grin2cQ01098 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Grin2cQ01098 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grin2cQ01098 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grin2cQ01098 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grin2cQ01098 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grin2cQ01098 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grin2cQ01098 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grin2cQ01098 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grin2cQ01098 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grin2cQ01098 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grin2cQ01098 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grin2cQ01098 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grin2cQ01098 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grin2cQ01098 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grin2cQ01098 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grin2cQ01098 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grin2cQ01098 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grin2cQ01098 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grin2cQ01098 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Grin2cQ01098 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grin2cQ01098 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grin2cQ01098 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grin2cQ01098 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grin2cQ01098 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grin2cQ01098 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grin2cQ01098 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grin2cQ01098 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Grin2cQ01098 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grin2cQ01098 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grin2cQ01098 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grin2cQ01098 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grin2cQ01098 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grin2cQ01098 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grin2cQ01098 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Grin2cQ01098 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Grin2cQ01098 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grin2cQ01098 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grin2cQ01098 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grin2cQ01098 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grin2cQ01098 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grin2cQ01098 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grin2cQ01098 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grin2cQ01098 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grin2cQ01098 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grin2cQ01098 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grin2cQ01098 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grin2cQ01098 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grin2cQ01098 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grin2cQ01098 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grin2cQ01098 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grin2cQ01098 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grin2cQ01098 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grin2cQ01098 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grin2cQ01098 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grin2cQ01098 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grin2cQ01098 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grin2cQ01098 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms