Protein–RNA interactions for Protein: Q00731

Vegfa, Vascular endothelial growth factor A, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfaQ00731 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
VegfaQ00731 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
VegfaQ00731 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms