Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms