Protein–RNA interactions for Protein: Q00558

F8a1, Factor VIII intron 22 protein, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8a1Q00558 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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F8a1Q00558 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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F8a1Q00558 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
F8a1Q00558 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
F8a1Q00558 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
F8a1Q00558 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
F8a1Q00558 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
F8a1Q00558 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
F8a1Q00558 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
F8a1Q00558 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
F8a1Q00558 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
F8a1Q00558 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms