Protein–RNA interactions for Protein: Q000W5

Gbp10, Guanylate-binding protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp10Q000W5 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gbp10Q000W5 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gbp10Q000W5 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gbp10Q000W5 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gbp10Q000W5 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gbp10Q000W5 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gbp10Q000W5 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gbp10Q000W5 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gbp10Q000W5 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gbp10Q000W5 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gbp10Q000W5 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gbp10Q000W5 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gbp10Q000W5 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gbp10Q000W5 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gbp10Q000W5 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gbp10Q000W5 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gbp10Q000W5 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gbp10Q000W5 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gbp10Q000W5 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gbp10Q000W5 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gbp10Q000W5 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gbp10Q000W5 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gbp10Q000W5 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gbp10Q000W5 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gbp10Q000W5 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gbp10Q000W5 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gbp10Q000W5 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gbp10Q000W5 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gbp10Q000W5 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gbp10Q000W5 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gbp10Q000W5 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gbp10Q000W5 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gbp10Q000W5 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gbp10Q000W5 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gbp10Q000W5 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gbp10Q000W5 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gbp10Q000W5 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gbp10Q000W5 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gbp10Q000W5 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gbp10Q000W5 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gbp10Q000W5 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gbp10Q000W5 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gbp10Q000W5 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gbp10Q000W5 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gbp10Q000W5 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gbp10Q000W5 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gbp10Q000W5 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gbp10Q000W5 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gbp10Q000W5 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gbp10Q000W5 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gbp10Q000W5 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gbp10Q000W5 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gbp10Q000W5 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gbp10Q000W5 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gbp10Q000W5 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gbp10Q000W5 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gbp10Q000W5 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gbp10Q000W5 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gbp10Q000W5 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gbp10Q000W5 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gbp10Q000W5 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gbp10Q000W5 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gbp10Q000W5 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gbp10Q000W5 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gbp10Q000W5 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gbp10Q000W5 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gbp10Q000W5 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gbp10Q000W5 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gbp10Q000W5 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gbp10Q000W5 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gbp10Q000W5 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gbp10Q000W5 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gbp10Q000W5 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gbp10Q000W5 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gbp10Q000W5 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gbp10Q000W5 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gbp10Q000W5 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gbp10Q000W5 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gbp10Q000W5 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gbp10Q000W5 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gbp10Q000W5 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gbp10Q000W5 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gbp10Q000W5 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gbp10Q000W5 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gbp10Q000W5 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gbp10Q000W5 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gbp10Q000W5 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gbp10Q000W5 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gbp10Q000W5 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gbp10Q000W5 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gbp10Q000W5 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gbp10Q000W5 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gbp10Q000W5 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gbp10Q000W5 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gbp10Q000W5 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gbp10Q000W5 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gbp10Q000W5 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gbp10Q000W5 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gbp10Q000W5 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gbp10Q000W5 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms