Protein–RNA interactions for Protein: P98195

Atp9b, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, mousemouse

Predictions only

Length 1,146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp9bP98195 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp9bP98195 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp9bP98195 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp9bP98195 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp9bP98195 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp9bP98195 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp9bP98195 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp9bP98195 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp9bP98195 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp9bP98195 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp9bP98195 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp9bP98195 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp9bP98195 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp9bP98195 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp9bP98195 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp9bP98195 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp9bP98195 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp9bP98195 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp9bP98195 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp9bP98195 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp9bP98195 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp9bP98195 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp9bP98195 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp9bP98195 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp9bP98195 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp9bP98195 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp9bP98195 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp9bP98195 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp9bP98195 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp9bP98195 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp9bP98195 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Atp9bP98195 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atp9bP98195 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atp9bP98195 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atp9bP98195 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Atp9bP98195 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atp9bP98195 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atp9bP98195 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp9bP98195 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp9bP98195 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp9bP98195 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp9bP98195 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp9bP98195 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp9bP98195 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp9bP98195 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp9bP98195 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp9bP98195 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp9bP98195 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp9bP98195 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp9bP98195 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp9bP98195 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp9bP98195 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp9bP98195 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp9bP98195 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp9bP98195 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp9bP98195 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp9bP98195 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp9bP98195 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp9bP98195 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp9bP98195 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp9bP98195 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp9bP98195 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp9bP98195 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp9bP98195 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp9bP98195 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp9bP98195 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp9bP98195 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp9bP98195 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp9bP98195 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp9bP98195 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp9bP98195 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp9bP98195 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp9bP98195 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp9bP98195 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp9bP98195 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp9bP98195 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp9bP98195 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp9bP98195 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp9bP98195 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp9bP98195 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp9bP98195 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp9bP98195 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp9bP98195 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp9bP98195 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp9bP98195 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp9bP98195 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp9bP98195 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp9bP98195 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp9bP98195 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp9bP98195 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp9bP98195 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp9bP98195 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp9bP98195 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp9bP98195 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp9bP98195 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp9bP98195 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp9bP98195 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp9bP98195 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp9bP98195 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp9bP98195 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms