Protein–RNA interactions for Protein: P97496

Smarcc1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc1P97496 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smarcc1P97496 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smarcc1P97496 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smarcc1P97496 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smarcc1P97496 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smarcc1P97496 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smarcc1P97496 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Smarcc1P97496 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Smarcc1P97496 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smarcc1P97496 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Smarcc1P97496 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Smarcc1P97496 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smarcc1P97496 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smarcc1P97496 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smarcc1P97496 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Smarcc1P97496 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smarcc1P97496 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smarcc1P97496 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smarcc1P97496 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smarcc1P97496 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smarcc1P97496 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smarcc1P97496 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smarcc1P97496 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smarcc1P97496 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smarcc1P97496 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smarcc1P97496 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smarcc1P97496 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smarcc1P97496 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smarcc1P97496 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Smarcc1P97496 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smarcc1P97496 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smarcc1P97496 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smarcc1P97496 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smarcc1P97496 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smarcc1P97496 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smarcc1P97496 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smarcc1P97496 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smarcc1P97496 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smarcc1P97496 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smarcc1P97496 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smarcc1P97496 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smarcc1P97496 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smarcc1P97496 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smarcc1P97496 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smarcc1P97496 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smarcc1P97496 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smarcc1P97496 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smarcc1P97496 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smarcc1P97496 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smarcc1P97496 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smarcc1P97496 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smarcc1P97496 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smarcc1P97496 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smarcc1P97496 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smarcc1P97496 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smarcc1P97496 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smarcc1P97496 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smarcc1P97496 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smarcc1P97496 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smarcc1P97496 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smarcc1P97496 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smarcc1P97496 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smarcc1P97496 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smarcc1P97496 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smarcc1P97496 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smarcc1P97496 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smarcc1P97496 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smarcc1P97496 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smarcc1P97496 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smarcc1P97496 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smarcc1P97496 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smarcc1P97496 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smarcc1P97496 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smarcc1P97496 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smarcc1P97496 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smarcc1P97496 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smarcc1P97496 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smarcc1P97496 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smarcc1P97496 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.2 ms