Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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