Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cbx1P83917 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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