Protein–RNA interactions for Protein: P83503

Nyx, Nyctalopin, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NyxP83503 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NyxP83503 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NyxP83503 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NyxP83503 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NyxP83503 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NyxP83503 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NyxP83503 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NyxP83503 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NyxP83503 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NyxP83503 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NyxP83503 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NyxP83503 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NyxP83503 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NyxP83503 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NyxP83503 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NyxP83503 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NyxP83503 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NyxP83503 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NyxP83503 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NyxP83503 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NyxP83503 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NyxP83503 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NyxP83503 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NyxP83503 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NyxP83503 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NyxP83503 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NyxP83503 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NyxP83503 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NyxP83503 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NyxP83503 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NyxP83503 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NyxP83503 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NyxP83503 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NyxP83503 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NyxP83503 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NyxP83503 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NyxP83503 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NyxP83503 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NyxP83503 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NyxP83503 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NyxP83503 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NyxP83503 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NyxP83503 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NyxP83503 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NyxP83503 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NyxP83503 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NyxP83503 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NyxP83503 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NyxP83503 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NyxP83503 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NyxP83503 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NyxP83503 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NyxP83503 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NyxP83503 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NyxP83503 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NyxP83503 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NyxP83503 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NyxP83503 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NyxP83503 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NyxP83503 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NyxP83503 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NyxP83503 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NyxP83503 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NyxP83503 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NyxP83503 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NyxP83503 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NyxP83503 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NyxP83503 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NyxP83503 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NyxP83503 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NyxP83503 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NyxP83503 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NyxP83503 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NyxP83503 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NyxP83503 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NyxP83503 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NyxP83503 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NyxP83503 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NyxP83503 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NyxP83503 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NyxP83503 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NyxP83503 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NyxP83503 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NyxP83503 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NyxP83503 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NyxP83503 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NyxP83503 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NyxP83503 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NyxP83503 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NyxP83503 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NyxP83503 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NyxP83503 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NyxP83503 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NyxP83503 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NyxP83503 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NyxP83503 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NyxP83503 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NyxP83503 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NyxP83503 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NyxP83503 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms