Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms