Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Otx1P80205 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Otx1P80205 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Otx1P80205 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Otx1P80205 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Otx1P80205 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Otx1P80205 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Otx1P80205 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Otx1P80205 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Otx1P80205 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Otx1P80205 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Otx1P80205 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Otx1P80205 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Otx1P80205 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Otx1P80205 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Otx1P80205 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Otx1P80205 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Otx1P80205 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Otx1P80205 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Otx1P80205 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Otx1P80205 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Otx1P80205 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Otx1P80205 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Otx1P80205 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Otx1P80205 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Otx1P80205 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Otx1P80205 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Otx1P80205 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Otx1P80205 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Otx1P80205 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Otx1P80205 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Otx1P80205 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Otx1P80205 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Otx1P80205 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Otx1P80205 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Otx1P80205 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Otx1P80205 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Otx1P80205 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Otx1P80205 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Otx1P80205 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Otx1P80205 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Otx1P80205 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Otx1P80205 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Otx1P80205 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Otx1P80205 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Otx1P80205 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Otx1P80205 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Otx1P80205 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Otx1P80205 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Otx1P80205 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Otx1P80205 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Otx1P80205 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Otx1P80205 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Otx1P80205 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Otx1P80205 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Otx1P80205 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Otx1P80205 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Otx1P80205 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Otx1P80205 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Otx1P80205 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Otx1P80205 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Otx1P80205 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Otx1P80205 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Otx1P80205 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Otx1P80205 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Otx1P80205 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Otx1P80205 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Otx1P80205 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Otx1P80205 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Otx1P80205 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Otx1P80205 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Otx1P80205 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Otx1P80205 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Otx1P80205 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Otx1P80205 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Otx1P80205 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Otx1P80205 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Otx1P80205 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Otx1P80205 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Otx1P80205 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Otx1P80205 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Otx1P80205 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Otx1P80205 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Otx1P80205 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Otx1P80205 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Otx1P80205 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Otx1P80205 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Otx1P80205 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Otx1P80205 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Otx1P80205 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Otx1P80205 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Otx1P80205 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Otx1P80205 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Otx1P80205 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Otx1P80205 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Otx1P80205 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Otx1P80205 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Otx1P80205 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Otx1P80205 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Otx1P80205 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms