Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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