Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp9xP70398 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp9xP70398 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp9xP70398 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp9xP70398 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp9xP70398 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp9xP70398 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp9xP70398 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp9xP70398 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp9xP70398 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp9xP70398 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp9xP70398 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp9xP70398 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp9xP70398 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp9xP70398 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp9xP70398 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp9xP70398 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp9xP70398 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp9xP70398 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp9xP70398 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp9xP70398 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp9xP70398 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp9xP70398 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp9xP70398 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp9xP70398 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp9xP70398 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp9xP70398 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp9xP70398 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp9xP70398 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp9xP70398 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp9xP70398 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp9xP70398 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp9xP70398 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp9xP70398 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp9xP70398 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp9xP70398 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp9xP70398 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp9xP70398 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp9xP70398 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp9xP70398 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp9xP70398 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp9xP70398 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp9xP70398 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp9xP70398 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp9xP70398 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp9xP70398 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp9xP70398 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp9xP70398 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp9xP70398 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp9xP70398 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp9xP70398 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp9xP70398 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp9xP70398 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp9xP70398 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp9xP70398 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp9xP70398 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp9xP70398 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp9xP70398 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp9xP70398 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp9xP70398 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp9xP70398 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp9xP70398 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp9xP70398 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp9xP70398 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp9xP70398 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp9xP70398 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp9xP70398 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp9xP70398 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp9xP70398 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp9xP70398 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp9xP70398 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp9xP70398 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp9xP70398 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp9xP70398 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp9xP70398 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp9xP70398 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp9xP70398 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp9xP70398 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp9xP70398 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp9xP70398 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp9xP70398 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp9xP70398 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp9xP70398 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp9xP70398 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp9xP70398 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp9xP70398 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp9xP70398 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp9xP70398 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp9xP70398 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp9xP70398 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp9xP70398 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp9xP70398 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp9xP70398 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp9xP70398 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp9xP70398 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp9xP70398 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp9xP70398 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp9xP70398 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp9xP70398 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Usp9xP70398 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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