Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rad50P70388 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rad50P70388 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rad50P70388 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rad50P70388 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rad50P70388 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rad50P70388 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Rad50P70388 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Rad50P70388 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rad50P70388 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Rad50P70388 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Rad50P70388 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rad50P70388 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rad50P70388 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Rad50P70388 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rad50P70388 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rad50P70388 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rad50P70388 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rad50P70388 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rad50P70388 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rad50P70388 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rad50P70388 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rad50P70388 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rad50P70388 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rad50P70388 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rad50P70388 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rad50P70388 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rad50P70388 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rad50P70388 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rad50P70388 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rad50P70388 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rad50P70388 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rad50P70388 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rad50P70388 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rad50P70388 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rad50P70388 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rad50P70388 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rad50P70388 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rad50P70388 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rad50P70388 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rad50P70388 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rad50P70388 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rad50P70388 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rad50P70388 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rad50P70388 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rad50P70388 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rad50P70388 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rad50P70388 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rad50P70388 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rad50P70388 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Rad50P70388 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rad50P70388 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rad50P70388 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Rad50P70388 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms