Protein–RNA interactions for Protein: P70270

Rad54l, DNA repair and recombination protein RAD54-like, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54lP70270 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rad54lP70270 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rad54lP70270 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rad54lP70270 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rad54lP70270 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rad54lP70270 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rad54lP70270 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rad54lP70270 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rad54lP70270 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rad54lP70270 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rad54lP70270 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rad54lP70270 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rad54lP70270 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rad54lP70270 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rad54lP70270 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rad54lP70270 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rad54lP70270 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rad54lP70270 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rad54lP70270 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rad54lP70270 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rad54lP70270 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rad54lP70270 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rad54lP70270 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rad54lP70270 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rad54lP70270 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rad54lP70270 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rad54lP70270 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rad54lP70270 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rad54lP70270 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rad54lP70270 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rad54lP70270 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rad54lP70270 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rad54lP70270 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rad54lP70270 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rad54lP70270 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rad54lP70270 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rad54lP70270 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad54lP70270 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad54lP70270 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad54lP70270 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad54lP70270 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad54lP70270 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad54lP70270 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad54lP70270 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad54lP70270 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad54lP70270 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad54lP70270 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad54lP70270 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad54lP70270 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad54lP70270 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad54lP70270 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad54lP70270 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad54lP70270 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad54lP70270 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad54lP70270 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad54lP70270 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad54lP70270 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad54lP70270 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad54lP70270 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad54lP70270 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad54lP70270 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad54lP70270 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad54lP70270 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad54lP70270 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rad54lP70270 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rad54lP70270 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rad54lP70270 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rad54lP70270 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rad54lP70270 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rad54lP70270 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Rad54lP70270 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rad54lP70270 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rad54lP70270 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rad54lP70270 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rad54lP70270 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rad54lP70270 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rad54lP70270 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rad54lP70270 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rad54lP70270 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rad54lP70270 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rad54lP70270 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rad54lP70270 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rad54lP70270 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rad54lP70270 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rad54lP70270 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rad54lP70270 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rad54lP70270 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rad54lP70270 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rad54lP70270 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rad54lP70270 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rad54lP70270 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rad54lP70270 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rad54lP70270 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rad54lP70270 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rad54lP70270 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rad54lP70270 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rad54lP70270 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rad54lP70270 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rad54lP70270 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rad54lP70270 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms