Protein–RNA interactions for Protein: P68500

Cntn5, Contactin-5, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn5P68500 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cntn5P68500 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cntn5P68500 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cntn5P68500 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cntn5P68500 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cntn5P68500 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cntn5P68500 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cntn5P68500 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cntn5P68500 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cntn5P68500 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cntn5P68500 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cntn5P68500 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cntn5P68500 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cntn5P68500 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cntn5P68500 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cntn5P68500 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cntn5P68500 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cntn5P68500 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cntn5P68500 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Cntn5P68500 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cntn5P68500 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cntn5P68500 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cntn5P68500 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cntn5P68500 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cntn5P68500 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cntn5P68500 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cntn5P68500 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cntn5P68500 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cntn5P68500 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cntn5P68500 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cntn5P68500 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cntn5P68500 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cntn5P68500 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cntn5P68500 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cntn5P68500 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cntn5P68500 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cntn5P68500 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cntn5P68500 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cntn5P68500 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cntn5P68500 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cntn5P68500 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cntn5P68500 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cntn5P68500 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cntn5P68500 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cntn5P68500 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cntn5P68500 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cntn5P68500 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cntn5P68500 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cntn5P68500 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cntn5P68500 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cntn5P68500 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cntn5P68500 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cntn5P68500 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cntn5P68500 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cntn5P68500 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cntn5P68500 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cntn5P68500 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cntn5P68500 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cntn5P68500 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cntn5P68500 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cntn5P68500 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cntn5P68500 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cntn5P68500 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cntn5P68500 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cntn5P68500 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cntn5P68500 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn5P68500 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn5P68500 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn5P68500 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn5P68500 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn5P68500 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn5P68500 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn5P68500 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn5P68500 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn5P68500 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn5P68500 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn5P68500 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn5P68500 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn5P68500 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn5P68500 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn5P68500 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn5P68500 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn5P68500 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn5P68500 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn5P68500 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn5P68500 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn5P68500 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cntn5P68500 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn5P68500 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn5P68500 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn5P68500 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn5P68500 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn5P68500 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn5P68500 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn5P68500 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn5P68500 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn5P68500 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn5P68500 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn5P68500 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn5P68500 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms