Protein–RNA interactions for Protein: P68404

Prkcb, Protein kinase C beta type, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcbP68404 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkcbP68404 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkcbP68404 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkcbP68404 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkcbP68404 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkcbP68404 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkcbP68404 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkcbP68404 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkcbP68404 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkcbP68404 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkcbP68404 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkcbP68404 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkcbP68404 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkcbP68404 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkcbP68404 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkcbP68404 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkcbP68404 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkcbP68404 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkcbP68404 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkcbP68404 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkcbP68404 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkcbP68404 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkcbP68404 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkcbP68404 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkcbP68404 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkcbP68404 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkcbP68404 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkcbP68404 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkcbP68404 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkcbP68404 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkcbP68404 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkcbP68404 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkcbP68404 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkcbP68404 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkcbP68404 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkcbP68404 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkcbP68404 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkcbP68404 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkcbP68404 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkcbP68404 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkcbP68404 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkcbP68404 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkcbP68404 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkcbP68404 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkcbP68404 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkcbP68404 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkcbP68404 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkcbP68404 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkcbP68404 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkcbP68404 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkcbP68404 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkcbP68404 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkcbP68404 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkcbP68404 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkcbP68404 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkcbP68404 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkcbP68404 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkcbP68404 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkcbP68404 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkcbP68404 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkcbP68404 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkcbP68404 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkcbP68404 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkcbP68404 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkcbP68404 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkcbP68404 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkcbP68404 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkcbP68404 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkcbP68404 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkcbP68404 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkcbP68404 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkcbP68404 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkcbP68404 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkcbP68404 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkcbP68404 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkcbP68404 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkcbP68404 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkcbP68404 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkcbP68404 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkcbP68404 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkcbP68404 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkcbP68404 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkcbP68404 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkcbP68404 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkcbP68404 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkcbP68404 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkcbP68404 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkcbP68404 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkcbP68404 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkcbP68404 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkcbP68404 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkcbP68404 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkcbP68404 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkcbP68404 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkcbP68404 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkcbP68404 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkcbP68404 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkcbP68404 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkcbP68404 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkcbP68404 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms