Protein–RNA interactions for Protein: P63072

Ubd, Ubiquitin D, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbdP63072 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
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UbdP63072 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
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UbdP63072 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
UbdP63072 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
UbdP63072 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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UbdP63072 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
UbdP63072 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
UbdP63072 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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UbdP63072 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
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UbdP63072 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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UbdP63072 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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UbdP63072 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
UbdP63072 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
UbdP63072 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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UbdP63072 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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UbdP63072 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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UbdP63072 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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UbdP63072 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
UbdP63072 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
UbdP63072 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
UbdP63072 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
UbdP63072 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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UbdP63072 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
UbdP63072 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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UbdP63072 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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UbdP63072 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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UbdP63072 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
UbdP63072 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
UbdP63072 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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UbdP63072 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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UbdP63072 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
UbdP63072 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
UbdP63072 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
UbdP63072 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms