Protein–RNA interactions for Protein: P63058

Thra, Thyroid hormone receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThraP63058 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ThraP63058 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ThraP63058 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ThraP63058 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ThraP63058 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ThraP63058 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ThraP63058 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ThraP63058 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ThraP63058 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ThraP63058 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ThraP63058 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ThraP63058 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ThraP63058 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ThraP63058 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ThraP63058 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ThraP63058 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ThraP63058 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ThraP63058 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ThraP63058 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ThraP63058 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ThraP63058 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ThraP63058 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ThraP63058 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ThraP63058 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ThraP63058 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ThraP63058 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ThraP63058 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ThraP63058 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ThraP63058 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ThraP63058 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ThraP63058 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ThraP63058 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ThraP63058 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ThraP63058 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ThraP63058 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ThraP63058 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ThraP63058 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
ThraP63058 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ThraP63058 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ThraP63058 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ThraP63058 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ThraP63058 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ThraP63058 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ThraP63058 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ThraP63058 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ThraP63058 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ThraP63058 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ThraP63058 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ThraP63058 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ThraP63058 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ThraP63058 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ThraP63058 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ThraP63058 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ThraP63058 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ThraP63058 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ThraP63058 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ThraP63058 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ThraP63058 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ThraP63058 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ThraP63058 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ThraP63058 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ThraP63058 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ThraP63058 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ThraP63058 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ThraP63058 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ThraP63058 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ThraP63058 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ThraP63058 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ThraP63058 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ThraP63058 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ThraP63058 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ThraP63058 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ThraP63058 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ThraP63058 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ThraP63058 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ThraP63058 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ThraP63058 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ThraP63058 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ThraP63058 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ThraP63058 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ThraP63058 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ThraP63058 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ThraP63058 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ThraP63058 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ThraP63058 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ThraP63058 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ThraP63058 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ThraP63058 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ThraP63058 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ThraP63058 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ThraP63058 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ThraP63058 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.05■□□□□ 0
ThraP63058 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ThraP63058 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ThraP63058 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ThraP63058 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ThraP63058 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ThraP63058 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ThraP63058 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ThraP63058 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms