Protein–RNA interactions for Protein: P62761

Vsnl1, Visinin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsnl1P62761 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms