Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Rps29P62274 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Rps29P62274 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Rps29P62274 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Rps29P62274 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Rps29P62274 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rps29P62274 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rps29P62274 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rps29P62274 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rps29P62274 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rps29P62274 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rps29P62274 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rps29P62274 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rps29P62274 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rps29P62274 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rps29P62274 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rps29P62274 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Rps29P62274 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rps29P62274 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rps29P62274 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rps29P62274 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rps29P62274 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rps29P62274 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rps29P62274 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rps29P62274 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rps29P62274 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rps29P62274 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rps29P62274 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rps29P62274 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rps29P62274 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rps29P62274 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Rps29P62274 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rps29P62274 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rps29P62274 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rps29P62274 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rps29P62274 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rps29P62274 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rps29P62274 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Rps29P62274 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rps29P62274 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rps29P62274 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rps29P62274 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rps29P62274 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rps29P62274 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rps29P62274 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rps29P62274 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rps29P62274 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rps29P62274 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rps29P62274 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rps29P62274 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rps29P62274 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rps29P62274 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rps29P62274 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rps29P62274 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rps29P62274 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rps29P62274 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Rps29P62274 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rps29P62274 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rps29P62274 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Rps29P62274 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rps29P62274 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Rps29P62274 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rps29P62274 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rps29P62274 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Rps29P62274 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Rps29P62274 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Rps29P62274 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Rps29P62274 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Rps29P62274 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Rps29P62274 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Rps29P62274 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Rps29P62274 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Rps29P62274 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Rps29P62274 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Rps29P62274 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Rps29P62274 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Rps29P62274 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Rps29P62274 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Rps29P62274 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Rps29P62274 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Rps29P62274 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Rps29P62274 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Rps29P62274 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Rps29P62274 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Rps29P62274 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Rps29P62274 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Rps29P62274 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Rps29P62274 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Rps29P62274 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Rps29P62274 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Rps29P62274 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Rps29P62274 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Rps29P62274 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Rps29P62274 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Rps29P62274 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Rps29P62274 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Rps29P62274 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Rps29P62274 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Rps29P62274 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Rps29P62274 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms