Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lmo4P61969 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lmo4P61969 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lmo4P61969 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lmo4P61969 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lmo4P61969 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lmo4P61969 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lmo4P61969 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lmo4P61969 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lmo4P61969 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lmo4P61969 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lmo4P61969 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lmo4P61969 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lmo4P61969 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lmo4P61969 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lmo4P61969 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lmo4P61969 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lmo4P61969 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lmo4P61969 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lmo4P61969 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lmo4P61969 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lmo4P61969 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lmo4P61969 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lmo4P61969 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lmo4P61969 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Lmo4P61969 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lmo4P61969 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lmo4P61969 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lmo4P61969 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lmo4P61969 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lmo4P61969 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lmo4P61969 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lmo4P61969 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lmo4P61969 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lmo4P61969 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lmo4P61969 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lmo4P61969 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Lmo4P61969 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lmo4P61969 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lmo4P61969 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lmo4P61969 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lmo4P61969 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lmo4P61969 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Lmo4P61969 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lmo4P61969 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Lmo4P61969 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lmo4P61969 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lmo4P61969 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lmo4P61969 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lmo4P61969 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lmo4P61969 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lmo4P61969 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lmo4P61969 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lmo4P61969 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lmo4P61969 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lmo4P61969 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lmo4P61969 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lmo4P61969 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lmo4P61969 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lmo4P61969 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lmo4P61969 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lmo4P61969 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lmo4P61969 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lmo4P61969 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lmo4P61969 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lmo4P61969 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lmo4P61969 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lmo4P61969 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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