Protein–RNA interactions for Protein: P60710

Actb, Actin, cytoplasmic 1, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ActbP60710 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
ActbP60710 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
ActbP60710 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
ActbP60710 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
ActbP60710 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
ActbP60710 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
ActbP60710 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
ActbP60710 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
ActbP60710 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
ActbP60710 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ActbP60710 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
ActbP60710 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
ActbP60710 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ActbP60710 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ActbP60710 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ActbP60710 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ActbP60710 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ActbP60710 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ActbP60710 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ActbP60710 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
ActbP60710 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ActbP60710 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ActbP60710 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ActbP60710 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ActbP60710 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ActbP60710 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ActbP60710 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ActbP60710 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ActbP60710 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ActbP60710 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ActbP60710 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ActbP60710 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ActbP60710 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ActbP60710 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ActbP60710 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ActbP60710 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ActbP60710 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
ActbP60710 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
ActbP60710 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ActbP60710 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ActbP60710 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ActbP60710 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ActbP60710 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ActbP60710 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ActbP60710 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ActbP60710 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ActbP60710 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ActbP60710 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ActbP60710 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ActbP60710 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ActbP60710 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ActbP60710 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ActbP60710 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ActbP60710 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ActbP60710 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ActbP60710 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ActbP60710 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ActbP60710 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ActbP60710 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ActbP60710 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ActbP60710 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ActbP60710 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ActbP60710 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ActbP60710 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ActbP60710 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ActbP60710 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ActbP60710 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ActbP60710 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ActbP60710 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ActbP60710 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ActbP60710 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ActbP60710 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ActbP60710 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ActbP60710 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ActbP60710 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ActbP60710 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ActbP60710 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ActbP60710 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ActbP60710 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ActbP60710 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
ActbP60710 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
ActbP60710 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
ActbP60710 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ActbP60710 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ActbP60710 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ActbP60710 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ActbP60710 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ActbP60710 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ActbP60710 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ActbP60710 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ActbP60710 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ActbP60710 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ActbP60710 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ActbP60710 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ActbP60710 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ActbP60710 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ActbP60710 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ActbP60710 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ActbP60710 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ActbP60710 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.6 ms