Protein–RNA interactions for Protein: P59222

Scarf2, Scavenger receptor class F member 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf2P59222 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scarf2P59222 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms