Protein–RNA interactions for Protein: P58466

Ctdsp1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp1P58466 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms