Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dpf3P58269 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dpf3P58269 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms