Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NcstnP57716 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NcstnP57716 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NcstnP57716 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NcstnP57716 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NcstnP57716 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NcstnP57716 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NcstnP57716 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
NcstnP57716 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NcstnP57716 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NcstnP57716 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NcstnP57716 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NcstnP57716 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NcstnP57716 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NcstnP57716 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NcstnP57716 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NcstnP57716 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NcstnP57716 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.05■□□□□ 0
NcstnP57716 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
NcstnP57716 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NcstnP57716 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NcstnP57716 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NcstnP57716 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NcstnP57716 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NcstnP57716 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NcstnP57716 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NcstnP57716 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NcstnP57716 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NcstnP57716 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NcstnP57716 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NcstnP57716 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NcstnP57716 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NcstnP57716 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
NcstnP57716 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NcstnP57716 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NcstnP57716 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NcstnP57716 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NcstnP57716 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NcstnP57716 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NcstnP57716 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NcstnP57716 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NcstnP57716 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NcstnP57716 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NcstnP57716 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NcstnP57716 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NcstnP57716 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NcstnP57716 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NcstnP57716 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NcstnP57716 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NcstnP57716 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NcstnP57716 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NcstnP57716 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NcstnP57716 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NcstnP57716 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NcstnP57716 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NcstnP57716 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NcstnP57716 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NcstnP57716 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NcstnP57716 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NcstnP57716 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NcstnP57716 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NcstnP57716 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NcstnP57716 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NcstnP57716 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NcstnP57716 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NcstnP57716 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NcstnP57716 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NcstnP57716 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NcstnP57716 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NcstnP57716 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NcstnP57716 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NcstnP57716 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NcstnP57716 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NcstnP57716 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NcstnP57716 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NcstnP57716 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NcstnP57716 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NcstnP57716 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NcstnP57716 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NcstnP57716 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NcstnP57716 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NcstnP57716 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NcstnP57716 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NcstnP57716 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NcstnP57716 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NcstnP57716 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NcstnP57716 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
NcstnP57716 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
NcstnP57716 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NcstnP57716 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NcstnP57716 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NcstnP57716 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NcstnP57716 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NcstnP57716 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NcstnP57716 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NcstnP57716 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NcstnP57716 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NcstnP57716 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NcstnP57716 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NcstnP57716 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms