Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp25P57080 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp25P57080 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp25P57080 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp25P57080 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp25P57080 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp25P57080 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp25P57080 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp25P57080 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp25P57080 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp25P57080 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp25P57080 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp25P57080 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms