Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Bace1P56818 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Bace1P56818 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bace1P56818 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bace1P56818 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Bace1P56818 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Bace1P56818 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bace1P56818 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Bace1P56818 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bace1P56818 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms